Publications LIRIS pour Anton Crombach (15)

• 2025 (1)
• Conférences (1)
• Conférences nationales avec comité de lecture (1)
•  Lisa Chabrier, Anton Crombach, Sergio Peignier & Christophe Rigotti (2025). « Re_actShap : détection de rebranchements des réseaux de régulation d’expression génique à l’aide des valeurs SHAP ». 25ième conference sur l'Extraction et Gestion des Connaissances (EGC), session demonstrations, Strasbourg (France), p. 8. HAL : hal-04877547. .
• 2024 (7)
• Revues (1)
• Revues internationales avec comité de lecture (1)
•  Lisa Chabrier, Anton Crombach, Sergio Peignier & Christophe Rigotti (2024). « Effective pruning for top-k feature search on the basis of SHAP values ». IEEE Access, vol. 12, pp. 163079-163092. doi : 10.1109/ACCESS.2024.3489958. HAL : hal-04549416. .
• Conférences (3)
• Conférences internationales avec comité de lecture (2)
•  Lisa Chabrier, Anton Crombach, Sergio Peignier & Christophe Rigotti (2024). « Detecting gene regulatory network rewiring as changes in marker regulatory associations using only single-cell gene expression data ». IEEE 12th Data Mining in Biomedical Informatics and Healthcare Workshop (DMBIH'24) at ICDM'24, Abu Dhabi (Émirats Arabes Unis), p. 10. HAL : hal-04808464. .
•  Ruggero Pensa, Anton Crombach, Sergio Peignier & Christophe Rigotti (2024). « Combining SHAP-driven Co-clustering and Shallow Decision Trees to Explain XGBoost ». 27th International Conference Discovery Science (DS'24), Pise (Italie), pp. 1-16. HAL : hal-04809871. .
• Autres conférences (1)
•  Lisa Chabrier, Anton Crombach, Sergio Peignier & Christophe Rigotti (2024). « Unraveling regulatory associations using explainable AI ». Journée GT Machine learning pour la génomique LEGO à JOBIM 2024, 25 juin 2024, Toulouse (France). HAL : hal-04783821.
• Autres (3)
•  Thibaut Peyric, Anton Crombach & Thomas Guyet (2024). « Single-cell multi-omics data integration powered by PCA-like autoencoders ». JOBIM 2024, 28 juin 2024, Toulouse (France). Poster. HAL : hal-04750060. .
•  Lisa Chabrier, Camille Leonce, Raphael Schneider, Cyril Dégletagne, Pierre Saintigny, Anton Crombach & Sandra Ortiz-Cuaran (2024). « Regulatory network inference of drug-tolerant persister cells ». AACR (American Association for Cancer Research) annual meeting - poster session, 10 avril 2024, San Diego (California) (États-Unis). Poster. HAL : hal-04879042.
•  Lisa Chabrier, Camille Leonce, Raphael Schneider, Cyril Dégletagne, Pierre Saintigny, Anton Crombach & Sandra Ortiz-Cuaran (2024). « Regulatory network inference of lung adenocarcinoma drug-tolerant persister cells ». Computational Biology of Cancer – BioSyL 2024 (COBICA) - poster session, 18 mars 2024, Grenoble (France). Poster. HAL : hal-04879089.
• 2022 (1)
• Autres (1)
•  Lisa Chabrier, Anton Crombach, Sergio Peignier & Christophe Rigotti (2022). « Semi-supervised learning for tree-based regressors to improve the prediction of the interactions between genes ». Symposium MaDICS, 11 juillet 2022, Lyon (France). Poster. HAL : hal-03894314. .
• 2021 (3)
• Revues (1)
• Revues internationales avec comité de lecture (1)
•  Sara Zeppilli, Tobias Ackels, Robin Attey, Nell Klimpert, Kimberly Ritola, Stefan Boeing, Anton Crombach, Andreas Schaefer & Alexander Fleischmann (2021). « Molecular characterization of projection neuron subtypes in the mouse olfactory bulb ». eLife. doi : 10.7554/eLife.65445. HAL : hal-03473445.
• Éditions scientifique d'ouvrages (livres, chapitres, colloques, congrès, n° spéciaux) (2)
•  Anton Crombach & Johannes Jaeger (2021). « Life’s Attractors Continued: Progress in Understanding Developmental Systems Through Reverse Engineering and In Silico Evolution ». Evolutionary Systems Biology: Advances, Questions, and Opportunities. doi : 10.1007/978-3-030-71737-7_4. HAL : hal-03128711. .
•  Anton Crombach (2021). « Evolutionary Systems Biology ». Anton Crombach, Springer International Publishing. doi : 10.1007/978-3-030-71737-7. HAL : hal-03473679.
• 2020 (1)
• Revues (1)
• Revues internationales avec comité de lecture (1)
•  Julie Marin, Guillaume Achaz, Anton Crombach & Amaury Lambert (2020). « The genomic view of diversification ». Journal of Evolutionary Biology, vol. 33, n°10, pp. 1387-1404. doi : 10.1111/jeb.13677. HAL : hal-03137815.
• 2019 (1)
• Revues (1)
• Revues internationales avec comité de lecture (1)
•  Elise Parey & Anton Crombach (2019). « Evolution of the Drosophila melanogaster Chromatin Landscape and Its Associated Proteins ». Genome Biology and Evolution, vol. 11, n°3, pp. 660-677. doi : 10.1093/gbe/evz019. HAL : hal-02064719.
• 2018 (1)
• Revues (1)
• Revues internationales avec comité de lecture (1)
•  Berta Verd, Erik Clark, Karl Wotton, Hilde Janssens, Eva Jiménez-Guri, Anton Crombach & Johannes Jaeger (2018). « A damped oscillator imposes temporal order on posterior gap gene expression in Drosophila ». PLoS Biology, vol. 16, n°2, p. 24. doi : 10.1371/journal.pbio.2003174. HAL : hal-01934923.