L’origine de la complexité des génomes eucaryotes demeure très débattue. En 2003, M. Lynch a proposé qu'elle soit issue d’un équilibre entre l’apparition de variants faiblement délétères et leur taux de fixation. Selon cette hypothèse, la taille efficace de la population, Ne, serait donc le premier facteur régulant la complexité des génomes. Bien que très populaire, cette hypothèse est difficile à tester empiriquement. Nous proposons d’utiliser le modèle d’évolution in silico « Aevol » afin de la tester dans des conditions parfaitement contrôlées. Pour cela le modèle sera modifié pour intégrer les caractéristiques structurelles des génomes eucaryotes. Nous évaluerons ensuite l’influence de Ne, des taux de mutation et de la dynamique des éléments transposables sur la complexité des génomes.