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Laboratoire d'InfoRmatique en Image et Systèmes d'information

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Laboratoire d'InfoRmatique en Image et Systèmes d'information
UMR 5205 CNRS / INSA de Lyon / Université Claude Bernard Lyon 1 / Université Lumière Lyon 2 / École Centrale de Lyon
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Guillaume Beslon

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Professor

Team Artificial Evolution and Computational Biology
 
Institution Institut National des Sciences Appliquées de Lyon
Location INRIA Antenne Lyon La Doua
 
E-mail guillaume.beslon at liris.cnrs.fr
URL http://liris.cnrs.fr/~gbeslon/
Contact details Publications

Publications LIRIS for Guillaume Beslon (55)

  • 2017 (1)
  • 2016 (11)
    • Journals (2)
      • International journals with peer review (2)
        •  Tim Taylor, Mark Bedau, Alastair Channon, David Ackley, Wolfgang Banzhaf, Guillaume Beslon, Emily Dolson, Tom Froese, Simon Hickinbotham, Takashi Ikegami et al. (2016). « Open-Ended Evolution: Perspectives from the OEE Workshop in York ». Artificial Life, vol. 22, 3, pp. 408-423. doi : 10.1162/ARTL_a_00210. HAL : hal-01371116. .
        •  Wolfgang Banzhaf, Bert Baumgaertner, Guillaume Beslon, René Doursat, James A Foster, Barry Mcmullin, Vinicius Veloso De Melo, Thomas Miconi, Lee Spector, Susan Stepney et al. (2016). « Defining and simulating open-ended novelty: requirements, guidelines, and challenges. ». Theorie in den Biowissenschaften / Theory in Biosciences. doi : 10.1007/s12064-016-0229-7. HAL : hal-01323108.
    • Conferences (8)
      • International conferences with peer review (8)
        •  Yoram Vadée-Le-Brun, Jonathan Rouzaud-Cornabas & Guillaume Beslon (2016). « In Silico Experimental Evolution suggests a complex intertwining of selection, robustness and drift in the evolution of genetic networks complexity ». Artificial Life, 8 july 2016, Cancun (Mexique). HAL : hal-01375645. .
        •  Guillaume Beslon, Vincent Liard & Santiago Elena (2016). « Evolvability drives innovation in viral genomes ». 2nd EvoEvo Workshop, satellite workshop of CCS2016, 20 september 2016, Amsterdam (France). HAL : hal-01375665. .
        •  Jacob Rutten, Paulien Hogeweg & Guillaume Beslon (2016). « Evolution of mutator populations in constant environments ». 2nd EvoEvo Workshop, satellite workshop of CCS2016, 20 september 2016, Amsterdam (Pays-Bas). HAL : hal-01375669. .
        •  Priscila Biller, Eric Tannier, Guillaume Beslon & Carole Knibbe (2016). « In silico experimental evolution provides independent and challenging benchmarks for comparative genomics ». Journées ouvertes Biologie Informatique Mathématiques, 30 june 2016, Lyon (France), pp. 79-82. HAL : hal-01375657. .
        •  Susan Stepney & Guillaume Beslon (2016). « Open-Endedness: Definitions and Shortcuts ». 2nd EvoEvo Workshop, satellite workshop of CCS2016, 20 september 2016, Amsterdam (Pays-Bas). HAL : hal-01375671. .
        •  Jonas Abernot, Guillaume Beslon, Simon Hickinbotham, Sergio Peignier & Christophe Rigotti (2016). « A Commensal Architecture for Evolving Living Instruments ». Conference on Computer Simulation of Musical Creativity, 19 june 2016, Huddersfield (Royaume-Uni). HAL : hal-01368034.
        •  Charles Rocabert, Carole Knibbe, Jessika Consuegra, Dominique Schneider & Guillaume Beslon (2016). « In Silico Experimental Evolution Highlights the Influence of Environmental Seasonality on Bacterial Diversification ». 2nd EvoEvo Workshop, satellite workshop of CCS2016, 20 september 2016, Amsterdam (Pays-Bas). HAL : hal-01375677. .
        •  Priscila Biller, Carole Knibbe, Guillaume Beslon & Eric Tannier (2016). « Comparative Genomics on Artificial Life ». Computability in Europe, Paris (France). HAL : hal-01334930.
    • Others (1)
  • 2015 (5)
  • 2014 (4)
  • 2013 (5)
    • Journals (3)
    • Conferences (1)
    • Book edition (books, chapters, seminars, congress, special numbers) (1)
      •  Hugues Berry & Guillaume Beslon (2013). « De la modélisation comme poésie. La modélisation de systèmes biologiques complexes vue par deux modélisateurs ». Modéliser & simuler. Epistémologies et pratiques de la modélisation et de la simulation, Franck Varenne and Marc Silberstein, Editions Matériologiques, Paris. HAL : hal-00815550.
  • 2012 (6)
  • 2011 (6)
    • Journals (2)
      • International journals with peer review (1)
        •  Antoine Coulon, Guillaume Beslon & Hédi Soula (2011). « Enhanced Stimulus Encoding Capabilities with Spectral Selectivity in Inhibitory Circuits by STDP ». Neural Computation, vol. 23, 4, pp. 882-908. HAL : inria-00593704.
      • National journals with peer review (1)
        •  Eric Bertin, Guillaume Beslon, Olivier Gandrillon, Sebastian Grauwin, Pablo Jensen & Nicolas Schabanel (2011). « Les complexités : point de vue d'un institut des systèmes complexes ». Hermès, La Revue- Cognition, communication, politique, 60, pp. 145-150. HAL : hal-00744520.
    • Conferences (2)
      • International conferences with peer review (2)
        •  David Parsons, Carole Knibbe & Guillaume Beslon (2011). « Homologous and Nonhomologous Rearrangements: Interactions and Effects on Evolvability. ». Proceedings of the Eleventh European Conference on the Synthesis and Simulation of Living Systems (ECAL 11), 8 august 2011, Paris (France), pp. 622-629. HAL : hal-00696902.
        •  Carole Knibbe, David P. Parsons & Guillaume Beslon (2011). « Parsimonious modeling of scaling laws in genomes and transcriptomes ». Proceedings of the Eleventh European Conference on the Synthesis and Simulation of Living Systems (ECAL 11), 8 august 2011, Paris (France), pp. 414-415. HAL : hal-00696870.
    • Others (2)
      •  José Viñuelas, Gaël Kaneko, Valérie Morin, Elodie Vallin, Antoine Coulon, Camila Meijia-Pous, Guillaume Beslon & Olivier Gandrillon (2011). « Chromatin is a major player in regulating gene expression stochasticity in higher eukaryotic cells ». Stochastic Systems Biology conference, 19 july 2011, Ascona (Suisse). HAL : hal-01354566.
      •  François Smekens, Jean-Michel Létang, Nicolas Freud, Bruno Sixou & Guillaume Beslon (2011). « Optimization of proton therapy ballistics using a genetic algorithm ». Particle Therapy Co-Operative Group, PTCOG, 8 may 2011, Philadelphia (US) (États-Unis). HAL : hal-01354428.
  • 2010 (7)
  • 2009 (4)
    • Conferences (2)
      • International conferences with peer review (1)
      • National conferences with peer review (1)
    • Book edition (books, chapters, seminars, congress, special numbers) (1)
      •  Antoine Coulon, Guillaume Beslon, François Chatelain, Alexandra Fuchs, Olivier Gandrillon, M Gineste, Jean-Jacques Kupiec, Camila Mejia-Perez & Andras Paldi (2009). « Mécanismes moléculaires et fonction biologique de la variabilité de l'expression génique à l'échelle de la cellule unique : une approche systémique ». Le Hasard au coeur de la cellule, Syllepse edition, pp. 82-111. doi : 10.3917/edmat.kupie.2011.01.0082. HAL : hal-01499539.
    • Others (1)
      •  José Viñuelas, Gaël Kaneko, Antoine Coulon, Guillaume Beslon & Olivier Gandrillon (2009). « Relationship between chromosomal features and gene expression stochasticity in higher eukaryotic cells ». Integrative Post-Genomics, 18 november 2009, Lyon (France). HAL : hal-01437813.
  • 2008 (5)
    • Journals (3)
      • International journals with peer review (2)
        •  Yolanda Sanchez-Dehesa, David P. Parsons, Jose Maria Pena & Guillaume Beslon (2008). « Modelling Evolution of Regulatory Networks in Artificial Bacteria ». Mathematical Modelling of Natural Phenomena, vol. 3, pp. 27-66. doi : 10.1051/mmnp:2008054. HAL : hal-01500393. .
        •  Christophe Lavelle, Hugues Berry, Guillaume Beslon, Francisco Ginelli, Jean-Louis Giavitto, Zoi Kapoula, André Le Bivic, Nadine Peyriéras, Ovidiu Radulescu, Adrien Six et al. (2008). « From Molecules to Organisms: Towards Multiscale Integrated Models of Biological Systems ». Theoretical Biology Insights, vol. 1, pp. 13-22. HAL : inria-00331281.
      • National journals with peer review (1)
    • Conferences (1)
      • National conferences with peer review (1)
        •  Victor Norris, Abdallah Zemirline, Patrick Amar, Pascal Ballet, Eshel Ben Jacob, Gilles Bernot, Guillaume Beslon, Eric Fanchon, Jean-Louis Giavitto, Nicolas Glade et al. (2008). « From bioputing to bactoputing: computing with bacteria ». Proceedings of the Lille Spring School on Modelling Complex Biological Systems in the Context of Genomics (France). HAL : hal-00340470.
    • HDR, thesis (1)
  • 2006 (1)
    • Journals (1)
      • International journals with peer review (1)
        •  Wolfgang Banzhaf, Guillaume Beslon, Stephen Christensen, A. James, François Képès, Virginie Lefort, F. Julian, Miroslav Radman & Jeremy J. Ramsden (2006). « Guidelines: From artificial evolution to computational evolution: a research agenda ». Nature Reviews Genetics, vol. 7, 9, pp. 729-735. HAL : hal-00793902.

External publications

Publications outside LIRIS for Guillaume Beslon (6)

  • 2012 (1)
    • Others (1)
      •  Bérénice Batut, Mathilde Dumond, Gabriel Marais, Guillaume Beslon & Carole Knibbe (2012). « Simulating evolutionary scenarios to test whether they can induce reductive evolution ». SMBE 2012 : Society for Molecular Biology and Evolution, 26 june 2012, Dublin (Irlande). HAL : hal-00762597.
  • 2009 (1)
    • Others (1)
      •  David Chavalarias, Paul Bourgine, Edith Perrier, Fréderic Amblard, François Arlabosse, Pierre Auger, Jean-Bernard Baillon, Olivier Barreteau, Pierre Baudot, Elisabeth Bouchaud et al. (2009). « French Roadmap for complex Systems 2008-2009 ». This second issue of the French Complex Systems Roadmap by the French National Network for Complex SYstems (http://RNSC.fr) and the Paris Ile-de-France Complex Systems Institute (http://iscpif.fr) is the outcome of the “Entretiens de Cargèse 2008”, an interdisciplinary brainstorming session organized over one week in 2008, jointly by RNSC, ISC-PIF and IXXI. It capitalizes on the first roadmap and gathers contributions of more than 70 scientists from major French institutions. HAL : hal-00392486. .
  • 2007 (1)
    • Conferences (1)
      • International conferences with peer review (1)
        •  Yolanda Sanchez-Dehesa, Loïc Cerf, Jose Maria Pena, Jean-François Boulicaut & Guillaume Beslon (2007). « Artificial Regulatory Networks Evolution ». Proc 1st Int Workshop on Machine Learning for Systems Biology MLSB 07, 25 september 2007, Evry (France), pp. 47-52. HAL : hal-01502737. .
  • 2005 (1)
    • Journals (1)
      • International journals with peer review (1)
        •  Hédi Soula, Céline Robardet, Fran\c Cois Perrin, Sébastien Gripon, Guillaume Beslon & Olivier Gandrillon (2005). « Modeling the emergence of multi-protein dynamic structures by principles of self-organization through the use of 3DSpi, a multi-agent-based software ». BMC Bioinformatics, vol. 6, p. 228. doi : 10.1186/1471-2105-6-228. HAL : hal-00759509.
  • 2004 (1)
    • Others (1)
      •  Hédi Soula, Guillaume Beslon & Olivier Mazet (2004). « Spontaneous Dynamics of Asymmetric Random Recurrent Spiking Neural Networks ». HAL : hal-00003305. .
  • 2002 (1)
    • Conferences (1)
      • International conferences with peer review (1)
        •  Tiphaine Martin, Céline Charavay, Audrey Herr, Céline Becquet, Hédi Soula, Aldo Deandrea, François Morlé, Olivier Gandrillon & Guillaume Beslon (2002). « 2DS'PI 2 Dimensional Dynamic Simulation of Proteins' Interactions ». Journées de post-génomique de la DOUA 2002, JPG'02, 24 june 2002, Lyon (France). HAL : inria-00615231.

Last update : 2016-02-12 12:28:56