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CarteTopo3D

Topological 3D Image Processing Software
Contact: guillaume.damiand@liris.cnrs.fr

Présentation

CarteTopo3D est un outil de traitement topologique d'images 3D. C'est un prototype implantant les travaux de recherche de Guillaume Damiand, puis de la thèse d'Alexandre Dupas. L'idée à la base de ces travaux est que de nombreux algorithmes de traitement d'images (à commencer par les algorithmes de segmentation, mais aussi les méthodes de calcul de caractéristiques ou les opérations de modifications) ont besoin de la topologie pour guider et structurer les traitements. Par informations topologiques, nous partons des informations les plus simple comme l'adjacence entre deux régions, jusqu'à des informations beaucoup plus complexes comme les groupes d'homologies.

Le logiciel

Le logiciel CarteTopo3D permet de charger une image 3D et d'en calculer la carte topologique 3D, un modèle combinatoire à base de carte combinatoire représentant la topologie des régions de l'image. Il permet ensuite :

de segmenter l'image, en utilisant ou non des critères topologiques
de visualiser l'image sous forme de voxels, d'intervoxels ou de coupes 3D
de simplifier l'image en supprimant les petites régions
de corriger la segmentation en fusionnant ou en découpant manuellement des régions
de retravailler partiellement le résultat de la segmentation en sélectionnant certaines régions et en relançant des algorithmes de split and merge
de calculer des caractéristiques topologiques des régions (caractéristiques d'Euler, nombres de Betti)

Quelques objets

Voici deux carptures d'écran du logiciel.
Et ici lors du traitement d'une image médicale. On peut voir la caractéristique d'Euler du volume sélectionné (un tore à 125 trous à gauche et à 100 trous à droite).
Deux représentation des structures de données utilisées : à gauche la carte combinatoire et à droite l'étiquetage en régions.

Pour plus d'informations

Pour plus d'information, contactez Guillaume Damiand. Vous pouvez consulter les principales publications en lien avec ce projet. Enfin, le source du logiciel peut éventuellement vous être fournis.